Estuda os ecossistemas de água doce, comunidades e funcionamento e o efeito das alterações globais, em zonas temperadas e tropicais. Tem desenvolvido métodos para a avaliação ecológica dos rios com invertebrados, algas e plantas ou processos. Tem estado envolvida nas várias fases de implementação da Directiva Quadro da Água em Portugal e países Mediterrânicos. Investiga o uso de técnicas moleculares na monitorização ecológica. Estuda os ribeiros urbanos, seus serviços e processos de restauração.