MARE é um centro de investigação científica, desenvolvimento tecnológico e inovação, com uma abordagem integradora e holística, concentrando grande diversidade de valências, capacidades e meios, com uma implantação territorial de âmbito nacional, que desenvolve as suas atividades de investigação orientadas para os problemas e desafios da sociedade, em estreita parceria com centros de investigação nacionais e internacionais.
É um centro multipolar criado em janeiro de 2015 que integra sete polos, seis em instituições de ensino superior portuguesas [Universidade de Coimbra (MARE-UCoimbra), Instituto Politécnico de Leiria (MARE-Politécnico de Leiria), Universidade de Lisboa (MARE-ULisboa), Universidade Nova de Lisboa (MARE-NOVA), ISPA - Instituto Universitário (MARE-ISPA), e Universidade de Évora (MARE-UÉvora), e um no arquipélago da Madeira (MARE-Madeira).
O MARE tem competências técnicas e científicas para abordar todos os ecossistemas aquáticos, incluindo bacias hidrográficas e áreas adjacentes, estuários, ecossistemas marinhos costeiros e oceânicos.
O MARE ambiciona ser uma instituição de referência nas Ciências do Mar e do Ambiente, contribuindo para o conhecimento do funcionamento dos ecossistemas aquáticos, promovendo o uso sustentável de recursos e a literacia dos oceanos.
O MARE procura a excelência no estudo dos ecossistemas aquáticos e dissemina esse conhecimento para apoiar o progresso humano e as políticas de desenvolvimento sustentável. Esta missão é concretizada através de redes colaborativas, desenvolvidas a nível nacional e internacional, com foco na investigação científica, na educação, na transferência de conhecimento e de tecnologia, e na divulgação de Ciência.