Investigação sobre ecossistemas marinhos e estuarinos, com ênfase em: a) Estrutura e funcionamento de comunidades em sistemas costeiros; b) Biologia, dinâmica e produção de populações de invertebrados; c) Estudos de poluição e de impacto ambiental; d) Desenvolvimento de indicadores ecológicos para avaliação de qualidade ambiental e da integridade de ecossistemas; e) Modelação ecológica; f) Aplicação de Ecotecnologia em gestão ambiental; g) Gestão e planeamento ambiental.